Il Consiglio di amministrazione, composto dal Presidente Mario Donno, dal Vicepresidente Mattia Giuseppe Granata e dal Consigliere Chiara Lazzarini approva i piani finanziari e gli atti di indirizzo e di programma ed esercita il controllo politico e amministrativo.

Fanno capo al Direttore generale, Giuseppe Zingale, le responsabilità operative e la gestione di tutte le risorse di AFOL Metropolitana, garantendo l’unitarietà e il coordinamento dell’azione amministrativa e di programmazione generale. Nella sua attività il Direttore generale è coadiuvato da un direttore territoriale per ciascuna area territoriale e dai responsabili di servizio.